孤立性内因性軟骨腫はより一般的な腫瘍で、主に手足の長い尿細管骨と短い尿細管骨に見られます。 腫瘍が成長するにつれて、罹患した骨の皮質は薄くなり、腫れます。 この状態は、指骨、中手骨、または中足骨でより一般的です。 孤立性の内因性軟骨腫は軟骨肉腫に変化する可能性がありますが、この悪性の変化は長い管状骨の軟骨腫ではより一般的であり、短い管状骨ではまれです。