หลอดอาหาร แต่กำเนิด (CES) หมายถึงความผิดปกติที่มีอยู่ในโครงสร้างแคบ ๆ ของผนังหลอดอาหารหลังคลอด มันยากมากในคลินิกและบ่อยกว่าในวัยเด็กและมักจะต้องผ่าตัด ในทางคลินิกมันควรจะแตกต่างจากหลอดอาหารตีบรอง