กะโหลก tracheoesophageal (tracheoesophageal fistula) เกิดจากความผิดปกติของตัวอ่อน แต่กำเนิดและหลอดลมและหลอดอาหารมีการเชื่อมต่อโดยทวาร. ประมาณครึ่งหนึ่งของผู้ป่วยจะมาพร้อมกับความผิดปกติ แต่กำเนิดของหัวใจและหลอดเลือด ส่วนใหญ่เป็นระยะ ๆ และมีเพียงไม่กี่คนที่มีประวัติครอบครัว