กลิ่นของมูลเกิดจากผลิตภัณฑ์ของการกระทำของแบคทีเรียเช่นอินโดล, skatole, mercaptans, ไฮโดรเจนซัลไฟด์และอื่น ๆ การตรวจสอบกลิ่นพิเศษของอุจจาระสามารถช่วยวินิจฉัยโรคทางเดินอาหารเบื้องต้นได้