ApoB ยังถูกสังเคราะห์โดยตับและเป็นโปรตีนโครงสร้างหลักของคอเลสเตอรอลชนิดไลโปโปรตีนชนิดความหนาแน่นต่ำ (LDL-CHOL) ซึ่งคิดเป็นประมาณ 97% ของปริมาณโปรตีนทั้งหมดของ LDL-CHOL การกำหนด ApoB สามารถสะท้อนระดับของ LDL-CHOL ได้โดยตรง