หลังจาก gastrectomy, น้ำดีไหลย้อนโรคกระเพาะระคายเคืองเยื่อเมือกและทำให้เกิดโรคกระเพาะเนื่องจากการไหลย้อนกลับของน้ำดีและน้ำตับอ่อนเข้าสู่กระเพาะอาหารที่เหลือ อุบัติการณ์ของการผ่าตัดแบบที่ 2 นั้นสูงกว่าการผ่าตัดแบบที่ 1