อัลคาไลน์ฟอสฟาเตสสามารถแบ่งออกเป็น 6 ชนิดโดยอิเลคโตรโฟรีซีส ได้แก่ ALP1, ALP2, ALP3, ALP4, ALP5, ALP6 การตรวจหา isoenzymes ที่เป็นด่างของอัลคาไลน์ฟอสฟาเทสสามารถช่วยวินิจฉัยโรคตับและถุงน้ำดี