胃鏡検査は食道、胃、十二指腸球の状況を観察できますが、食道鏡検査は食道を擦ることに特化した診断器具で、どちらも口を通って観察部位に入ります。装置に入った後、不快感がある場合は、深呼吸をして口の中の液体を吐き出します。検査は通常2〜5分で完了します。異常がある場合は、病理検査のために標本を収集するのに時間がかかります。